كانت القبلة في البداية في الجدار الشمالي للمسجد النبوي ناحية المسجد الأقصى، ثم تم تحويلها في العام الثاني من الهجرة /624م ناحية الكعبة في الجدار الجنوبي.
ولذلك أطلق على المسجد مسجد القبلتين ثم أمر الرسول (صلى الله عليه وسلم) باتخاذ ظله ثانية وبذلك أصبح للمسجد ظلتان يتوسطهما فناء مكشوف.
وجعل في وسط الجدار الجنوبي علامة تبين القبلة التي تم تحدديها بمساعدة جبريل (عليه السلام).
ولهذا لم يحدث انحراف في قبلته كما حدث في مساجد أخرى مثل مسجد عمرو بن العاص والقيروان والقرويين وواسط.
ولم يتخذ الرسول في أول الأمر منبرا بل كان يقف على جذع من جذوع النخل.
