هناك مجموعة من المعوقات التي تحول دون بلوغ التعليم الإلكتروني لأهدافه وأوجزها فيما يلي:
- ضعف البنية التحتية في غالبية الدول النامية.
- عدم إلمام المتعلمين بمهارات استخدام التقنيات الحديثة.
- عدم اقتناع أعضاء هيئة التدريس بالجامعات باستخدام الوسائط الإلكترونية الحديثة في التدريس أو التدريب.
- التكلفة العالية في تصميم وإنتاج البرمجيات التعليمية.
