يصيب فيروس الهربس الجنسي الأعضاء التناسلية، ويكون وصول الفيروس إلى هذه المناطق غالبا عن طريق العلاقة الجنسية العادية أو عن طريق العلاقة الجنسية بواسطة الفم.
يؤدي مرض الهربس التناسلي إلى تسلخات وآلام حادة بالعضو التناسلي وقد يتبعه ندبات خاصة وأن المرض يظهر مرة ومرات ويؤدي إلى مشاكل نفسية واجتماعية وعضوية للمصاب وقد يسبب سرطانا بالعضو.
أما في الأنثى فإن مرض الهربس التناسلي قد يؤدي إلى سرطان الرحم.